"Signalis" to gra osadzona w dystopijnej przyszłości, w której ludzkość skolonizowała Układ Słoneczny, a Eusan – za sprawą totalitarnego reżimu opartego na agresywnej inwigilacji i propagandzie – trzyma wszystkich w żelaznym uścisku. Humanoidalne androidy znane jako Repliki żyją w społeczeństwie, pełniąc funkcje robotników, urzędników oraz protektorów wśród obywateli, których mają przypominać.

Fabuła gry "Signalis" zaczyna się w momencie, w którym Replika imieniem Elster budzi się z kriostazy we wraku statku kosmicznego. Bohaterka jest sama na zimnej planecie, gdzie rozpoczyna podróż w nieznane.