Żaden młody człowiek, bez względu na to, jak jest potężny, nie zna swego przeznaczenia.

Zamek Camelot, na kilka lat przed tym, gdy zaczął się okres jego największej świetności. Fantastyczne miejsce zamieszkałe przez legendarne bestie i nietuzinkowych ludzi. To niebezpieczny świat, w którym używanie magii zostało zakazane przez tyrana - Uthera Pendragona. Gdy do zamku przybędzie Merlin, młodzieniec obdarzony niesamowitymi, magicznymi zdolnościami, szybko narobi sobie wrogów. Jego przeciwnikiem stanie się najpoważniejszy kandydat do korony, pyszałkowaty książę Artur. Niemniej Merlin, dzięki światłemu przewodnictwu nadwornego alchemika Gaiusa, nie tylko zdoła przetrwać, ale i pozna największe sekrety królestwa Camelot. Odkryje także, że jego losy są nierozerwalnie powiązane z dziedzicem korony – młodym Arturem.

Film zaczyna się gdy młody Merlin przybywa do Camelotu. Jego matka postanowiła oddać go pod opiekę nadwornego medyka w nadziei, że ten nakieruje nadzwyczajny talent chłopca na odpowiednie tory. Problemem jednak jest to, że obecnie władający Camelotem król Uther zakazał używania magii pod groźbą kary śmierci. Merlin poznaje i z miejsca obdarza (odwzajemnioną) pogardą królewskiego syna – zuchwałego, pyszałkowatego i zawziętego księcia Artura. Merlin odkrywa, że jego przeznaczeniem jest bronić Artura. Jako sługa księcia nie raz ratuje nieświadomego magicznych zdolności Merlina, Artura...

Camelot, siedziba królów, to nie jest miejsce sprzyjające młodym czarodziejom, ale to właśnie w nim Merlin (Colin Morgan) odnajduje przeznaczenie. Dzięki swojej mocy ma dokonać wielkich czynów, lecz nie może się ujawnić, bo takich jak on król Uther (Anthony Head) skazuje na śmierć. Ciekawym zbiegiem okoliczności Merlin zostaje sługą Artura (Bradley James), za którym nieszczególnie przepada. Pierwsze ich spotkanie nie wskazuje jednak na to, że staną się najlepszymi przyjaciółmi, a Merlin będzie gotowy oddać za niego życie.